Пунктом другим наказу МОН від 16.03.2020 №406 «Про організаційні заходи для запобігання поширенню коронавірусу СОVID-19» закладам освіти було рекомендовано запроваджувати гнучкий (дистанційний) режим роботи працівників відповідно до Методичних рекомендацій щодо встановлення гнучкого режиму робочого часу, затверджених наказом Міністерства праці та соціальної політики України від 04.10.2006 року №359. Керівник закладу освіти повинен забезпечити облік відпрацьованого робочого часу та контроль за трудовою дисципліною працюючих в цьому режимі.
Наразі керівникам закладів освіти надходять рекомендації щодо нездійснення оплати педагогічним працівникам під час карантину за завідування кабінетом, класне керівництво, перевірку зошитів, скасування надбавки за складність і напруженість у роботі. Окрім того, поширюється інформація про необхідність оплати праці практичних психологів, соціальних педагогів, педагогів-організаторів, керівників гуртків, музичних керівників закладів освіти з розрахунку 2/3 посадового окладу.
У спільному листі Міністерства освіти і науки України № 1/9-162 та ЦК Профспілки працівників освіти і науки України № 02-5/202 від 17.03.2020 «Про умови та оплату праці працівників закладів освіти і науки в умовах карантину» міністерство та ЦК Профспілки наголошується на необхідності збереження за працівниками на період карантину середньої заробітної плати. У роз’ясненні МОН (лист від 13.03.2020 №1/9-161) також йдеться про те, що на період карантину за працівниками зберігається середня заробітна плата. При цьому оплата праці педагогічних працівників закладів освіти у випадках, коли в окремі дні (місяці) заняття не проводяться з незалежних від них причин (епідемії тощо), має здійснюватися із розрахунку заробітної плати, встановленої при тарифікації.
Під час карантину особливої актуальності набуває використання мережі Інтернет та засобів електронного зв’язку при зверненні до органів влади чи місцевого самоврядування.
У листі МОНУ № 1/9-182 від 31 березня 2020 року «Щодо організованого завершення 2019/2020 навчального року та зарахування до закладів загальної середньої освіти» зазначено, що освітній процес у закладах загальної середньої освіти організовується в межах навчального року, що закінчується не пізніше 1 липня.